業績

著書

2025年

• "AIとバイオの融合最前線、（第4章８節代謝改変のための計算手法を援用した酵素基質特異性の調節と新機能開拓）"
  二井手哲平、戸谷吉博、清水浩
  CMC出版 (2025).

2024年

• "物質生産のための微生物代謝のin silicoデザイン、微生物を用いた有用物質生産技術の開発第１章第４節"
  戸谷吉博、清水浩
  技術情報協会, １９－２６ (2024).

2023年

• "13C代謝フラックス解析を利用したイソプロピルアルコール生産大腸菌の代謝改良、微生物を活用した有用物質の製造技術"
  清水浩
  CMC出版 (2023).

2021年

• "第Ⅳ部、3. 光合成のカギとなる段階を探せ"
  清水 浩, 豊島 正和
  光合成 (朝倉書店), 174-178 (2021).

2018年

• "第25章 培養動物細胞の13C代謝フラックス解析"
  岡橋 伸幸, 松田 史生, 清水 浩
  代謝センシング-健康,食,美容,薬,そして脳の代謝を知る- (シーエムシー出版), 218-228 (2018).

2017年

• "Chapter 8, Control of Microbial Processes"
  Kazuyuki Shimizu, Hiroshi Shimizu, Toshiomi Yoshida
  BIOTECHNOLOGY, Wiley-VCH book series, Weinheim, Vol 5: Applied Bioengineering: Innovations and Future Directions, 237- 258 (2017).
• "Chapter 7, Omics integrations for the state analysis of microbial processes"
  Hiroshi Shimizu, Chikara Fursawa, Takashi Hirasawa, Katsunori Yoshikawa, Yoshihiro Toya, Tomokazu Shirai, Fumio Matsuda
  BIOTECHNOLOGY, Wiley-VCH book series, Weinheim, Vol 5: Applied Bioengineering: Innovations and Future Directions, 201-236 (2017).

2016年

• "Chapter 11. Glutamic acid fermentation: Discovery of glutamic acid-producing microorganisms, analysis of the production mechanism, metabolic engineering and industrial production process"
  Takashi Hirasawa, Hiroshi Shimizu
  BIOTECHNOLOGY, Wiley-VCH book series, Weinheim, Vol 4: Indsutrial Biotechnology Products and Processes, 339-360 (2016).

2014年

• "Chapter 17 Glutamic Acid"
  Takashi Hirasawa, Hiroshi Shimizu
  Bioprocessing of Renewable Resources to Commodity Bioproducts (Weiley), 473-495 (2014).

2012年

• "第2節　ゲノムスケール代謝デザインとフラックス解析による微生物細胞創製"
  清水 浩, 古澤 力, 白井 智量, 吉川 勝徳, 平沢 敬
  合成生物工学の隆起 ―有用物質の新たな生産法構築をめざして― 第3章 オミクス解析の視点 (シーエムシー出版), 57-66 (2012).
• "第12章 ゲノム・生物情報工学"
  清水 浩
  遺伝子工学 (化学同人), 170-181 (2012).
• "Chapter3, Design of Superior Cell Factories Based on Systems Wide Omics Analysis"
  Katsunori Yoshikawa, Chikara Furusawa, Takashi Hirasawa, Hiroshi Shimizu
  Systems Metabolic Engineering (Springer), 57-82 (2012).
• "Molecular mechanisms and metabolic engineering of glutamate overproduction in Corynebacterium glutamicum (Springer)"
  Takashi Hirasawa, Jongpill Kim, Tomokazu Shirai, Chikara Furusawa, Hiroshi Shimizu
  Subcellular Biochemistry Vol. 64, Reprogramming Microbial Metabolic Pathways (Springer), 261-281 (2012).
• "Systems metabolic engineering: the creation of microbial cell factories by rational metabolic design and evolution"
  Chikara Furusawa, Takaaki Horinouchi, Takashi Hirasawa, Hiroshi Shimizu
  Advanced Biochemical Engineering/Biotechnology (Springer), 1-23 (2012).

2008年

• "メタボロミクスの先端技術と応用, 第14章メタボロームデータを用いた代謝フラックス解析 (シーエムシー出版)"
  清水 浩, 古澤 力, 白井 智量
  (2008).

2007年

• "Production of glutamate and glutamate-related amino acids: molecular mechanism analysis and metabolic engineering, Amino Acid Biosynthesis – Pathways, Regulation and Metabolic Engineering"
  Hiroshi Shimizu, Takashi Hirasawa
  Microbiology Monographs (Springer) 5, 1-38 (2007).

2006年

• "４章メタボリックエンジニアリング"
  清水 浩
  バイオプロダクション, 化学工学会バイオ部会編 (コロナ社), 57-62 (2006).
• "代謝制御解析"
  清水 浩
  バイオインフォマティクス事典, バイオインフォマティクス学会編 (共立出版), 716-717 (2006).
• "代謝フラックス解析"
  清水 浩
  バイオインフォマティクス事典, バイオインフォマティクス学会編 (共立出版), 709-711 (2006).

2005年

• "７章 培養工学, 7.5.3 代謝工学的手法と培養操作の実際"
  清水 浩
  生物工学ハンドブック, 日本生物工学会編, 444-449 (2005).

2004年

• "Analysis of responses of complex bionetworks to changes in environmental conditions"
  Hiroshi Shimizu, Takashi Hirasawa, Keisuke Nagahisa, Suteaki Shioya
  Lecture Note Series of Computer Science Vol. 3141, Biologically Inspired Approaches to Advanced Information Technology (Springer), 13-27 (2004).